Рисовать средствами игры поверх определенной панели.
imgui генерирует геометрию в список отрисовки, затем в хуке D3D9 ты вызываешь оригинальную отрисовку где игра рисует все свои слои (включая оверлей), и затем поверх рисуешься ты, т.е. ты не можешь никак вклиниться где-то между.
Поэтому всегда отрисовка собственными средствами будет поверх консоли, оверлея и самой игры.